呼吸机的消毒应遵循先彻底清洗，尤其是接触患者的呼出气体的部分，如管道、加温湿化器和呼气阀等（部分呼吸机带细菌过滤器），可先用清洗剂冲洗，将其中的分泌物，痰痂等彻底清除，然后再消毒。消毒后经蒸馏水冲洗晾干备用。经化学消毒剂消毒后的呼吸机管路应用蒸馏水清洗，而不建议用自来水，以免造成不必要的污染。

呼吸机管路清洁：

(1)管路清洁：要仔细检查管道内有无痰痂、血渍、油污及其他脏物残留，若不冲洗干净则难以达到彻底消毒的目的。

(2)传感器的清洗：由于传感器属精密的电子产品，价格昂贵，并且有各自的性能特点，必须根据各自呼吸机的说明书或操作指南进行清洗。

(3)呼吸机内部主机的清洁：呼吸机内部主机多为电子原件，不能使用常规方法清洁，需由工程师定期保养。

(4)呼吸机外壳的清洁：呼吸机外壳可用温水纱布轻轻擦净。明显污染时可用酒精或含氯消毒剂擦拭。

呼吸机管路消毒：

目前，呼吸机管路的消毒常用方法有化学消毒方法、气体熏蒸法、热力消毒法。

消毒过程两步骤：

用清洗方法去除尽可能多的微生物；化学、熏蒸灭菌方法去除剩余的微生物。

(1)化学消毒方法

常用的有含氯消毒液、2%戊二醛碱性溶液、0.5%过氧乙酸溶液。

被消毒器材必须去净痰迹、血迹、油污等。

被消毒物品必须全部浸入溶液中，彻底脱开各个连接部件。

消毒完毕，必须用灭菌蒸馏水将消毒液冲洗干净。

(2)气体熏蒸法

环氧乙烷气体消毒可杀死霉菌，孢子及较大的病毒。环氧乙烷可穿透橡胶、塑料、玻璃纸、纸报等，无腐蚀性和破坏性，是比较理想的消毒方法。

环氧乙烷消毒后，有效期为一年，但消毒后不能立即使用，需经一周时间待环氧乙烷挥发尽后，才能使用。

(3)热力消毒法：高温高压消毒法

湿化器的消毒:

在呼吸机使用过程中，装有过滤纸者应更换过滤纸，及时更换液体(使用中的呼吸注意湿化器内应注入无菌蒸馏水，以免液体中的结晶物沉淀而损害蒸发器，影响湿化效果。）为避免病原微生物的生长，繁殖及呼吸机腐蚀损坏，每次使用后应倒掉湿化器内的液体；浸泡消毒，晾干备用。

传感器的消毒：75%酒精浸泡15分钟，自然风干。一个病人使用后消毒一次。

呼气盒的消毒：中空的，先用水冲洗，75%酒精浸泡12h，灭菌蒸馏水冲洗，晾干。

加热导线的消毒：75%酒精浸泡30分钟。